Statut et menaces des grenouilles
Les amphibiens comptent parmi les groupes de vertébrés dont les effectifs reculent le plus vite à l'échelle mondiale, et les grenouilles françaises n'échappent pas à ce mouvement. Leur sensibilité tient à un cycle de vie coupé en deux : une phase larvaire entièrement aquatique, puis une phase adulte terrestre qui réclame des abris humides. Toute atteinte portée à l'un des deux milieux, ou à ce qui les relie, suffit à faire disparaître une population locale. S'y ajoute une peau fine et très perméable, qui assure une part des échanges respiratoires et laisse passer les substances dissoutes dans l'eau.
La réglementation française place l'ensemble des amphibiens indigènes sous un régime de protection stricte. Selon les espèces, l'interdiction porte sur la destruction, la mutilation, la capture et le transport des individus, sur le ramassage des œufs et des têtards, et pour les espèces les plus menacées sur l'altération des sites de reproduction et de repos. Combler une mare occupée, drainer une prairie humide ou détruire une haie en période de migration tombe donc sous le coup de cette interdiction, indépendamment du statut foncier du terrain. Une dérogation reste possible pour un projet d'aménagement, mais elle suppose un dossier instruit par les services de l'État et des mesures de compensation. Plusieurs espèces figurent par ailleurs aux annexes de la directive européenne sur les habitats, ce qui engage la désignation de sites protégés et un suivi de leur état de conservation.
Le comblement et le drainage des petits points d'eau ont fait reculer les grenouilles bien avant les autres causes de déclin. Les mares d'abreuvement sont devenues inutiles avec la généralisation des abreuvoirs, les fossés ont été busés, les prairies inondables ont été assainies et retournées. Le phénomène est d'autant plus dommageable que la plupart des espèces reviennent pondre dans le point d'eau où elles sont nées : la suppression d'une mare ne déplace pas la population, elle la supprime. Les plans d'eau de substitution, creusés profonds et empoissonnés, ne remplissent pas le même rôle, les poissons consommant les pontes et les jeunes têtards.
Les migrations de reproduction amènent des centaines d'adultes à traverser la même portion de chaussée en quelques nuits de fin d'hiver, dès que la température s'adoucit et que la pluie arrive. La mortalité routière atteint sur ces passages des niveaux qui compromettent la population entière, parce qu'elle frappe des adultes reproducteurs, les individus les plus coûteux à remplacer. Deux réponses existent : la fermeture temporaire de la route aux heures de migration, et le passage à faune, souvent appelé crapauduc, qui associe une buse sous la chaussée à des barrières de guidage. Le dispositif ne fonctionne que si les barrières couvrent tout le front de passage, faute de quoi les animaux les contournent.
Un champignon pathogène, Batrachochytrium dendrobatidis, a provoqué l'effondrement de populations d'amphibiens sur plusieurs continents. Il s'attaque à la peau et perturbe les échanges d'eau et de sels minéraux, ce qui entraîne la mort des individus atteints. Une seconde espèce de ce même genre, signalée en Europe depuis les années 2010, touche surtout les salamandres et les tritons. La propagation suit le commerce d'animaux de terrarium et le transport accidentel de spores sur les bottes et le matériel de pêche, ce qui explique les consignes de désinfection appliquées aux personnes qui travaillent sur plusieurs mares. La pollution des eaux par les nitrates et les produits phytosanitaires joue un rôle aggravant, en abaissant la résistance des larves aux infections.